About the RUFORUM 2010 Biennal Conference
"The 2010 RUFORUM Biennial Conference was the second in the series. The main objective of the Biennial conferences is to provide a platform for agricultural research for development stakeholders in Africa and beyond to actively exchange findings and experiences, while at the same time learning lessons towards improving performance of the agricultural sector and ultimately people’s livelihoods. The biennial conference is RUFORUM’s most comprehensive meeting for the diversity of stakeholders in agriculture. It is especially dedicated to graduate students and their supervisors, grantees in RUFORUM member universities and alumni. It is a platform for peer review, quality control, mentorship, networking and shared learning. This record contains an extended abstract accepted under the theme of Crop Protection"
Differential gene expression in nematode-susceptible and -tolerant East African highland bananas following inoculation with non-pathogenic Fusarium oxysporum endophytes
Abstract:
Endophytic non-pathogenic Fusarium oxysporum isolates have
been shown to reduce Radopholus similis populations through
induced resistance. We used cDNA-AFLPs to identify genes
induced in banana plants susceptible (cv Nabusa, AAA-EA)
and tolerant (cv Kayinja, ABB) to the nematode following
colonization by endophytic isolates Emb2.4o and V5w2.
Nematode challenge of plants was carried out 30 days after
endophyte inoculation and roots harvested for RNA extraction
3 days later. Fifty up-regulated genes were assigned putative
identities. Of interest to the current study was the up-regulation
of genes involved in signal transduction, cell wall strengthening,
the jasmonic acid pathway and transport of defence molecules.
The expression profiles of differentially expressed fragments
with similarity to ABC transporter, coronatine insensitive 1
(COI1), lipoxygenase (LOX) and â 1,3-glucan synthase
genes were confirmed using quantitative real-time PCR.
Challenge of endophyte-inoculated plants with R. similis resulted
in further up-regulation of the activities of â-1,3-glucan
synthase and COI1 in the susceptible cv Nabusa, and that of
COI1 and LOX in the tolerant cv Kayinja. Our results confirm
induced resistance as a mode of action for F. oxysporum
endophyte control of R. similis in banana. This investigation
represents the first report of the isolation and identification of
genes involved in the interaction between endophytic F.
oxysporum and banana.
Les isolants endophytes non pathogènes de Fusarium oxysporum
ont montré une réduction des populations Radopholus similis à
travers la résistance induite. Nous avons utilisé l’ADNc-AFLPs pour identifier les gènes induits dans les bananiers sensibles (cv
Nabusa, AAA-EA) et tolérant (cv Kayinja, ABB) au nématode
suite à la colonisation par les endophytes isolants Emb2.4o et
V5w2. Le défi de nématode des plantes a été effectué 30 jours
après l’inoculation d’endophyte et de racines récoltées pour
l’extraction de l’ARN 3 jours plus tard. Cinquante gènes régulés
à la hausse ont été affectés d’identités putatives. L’intérêt pour
l’étude actuelle a été la régulation positive des gènes impliqués
dans la transduction du signal, le renforcement de la paroi
cellulaire, la voie de l’acide jasmonique et le transport de molécules
de défense. Les profils d’expression des fragments se sont
différemment exprimés, présentant une similitude avec des
transporteurs ABC, coronatine insensibles 1 (COI1), la
lipoxygénase (LOX) et les gènes d’un 1,3-glucane synthase ont
été confirmés par PCR quantitative en temps réel. Le défi des
plantes inoculées avec endophytes R. similis a entraîné en outre
une régulation des activités de A-1 ,3-glucane synthase et COI1
dans le cultivar sensible Nabusa, et celle de COI1 et LOX dans le
cv tolérante Kayinja. Nos résultats confirment la résistance induite
par un mode d’action pour le contrôle de F. oxysporum endophyte
de R. similis chez le bananier. Cette enquête constitue le premier
rapport de l’isolement et l’identification de gènes impliqués dans
l’interaction entre F. oxysporum endophytes et de la banane.
Language:
English
Date of publication:
2010
Country:
Region Focus:
Southern Africa
University/affiliation:
Collection:
RUFORUM Conferences and Workshops
Agris Subject Categories:
Agrovoc terms:
Additional keywords:
Licence conditions:
Open Access
Access restriction:
Form:
Printed resource
Publisher:
ISSN:
E_ISSN:
Edition:
Extent:
1057-1061
Notes: