Abstract:
Understanding of genetic diversity among a breeding population is an important requirement for crop improvement
as it allows for the selection of diverse parental combinations and formation of heterotic pools for genetic gain.
This study was carried out to determine genetic diversity within and among 51 farmer-preferred cassava (Manihot
esculenta) landraces and 15 elite accessions grown in Uganda. Twenty six simple sequence repeat (SSR) markers
used for genetic diversity assessment in this study revealed a total of 154 alleles, of which 24% were unique
alleles present only in landraces. The genetic diversity and observed herozygosity in landraces were slightly
higher than in elite accessions. Elite accessions clustered with some of the landraces indicating that there were
some alleles in common. However, 58.8% of the landraces fell into 3 different clusters independent of the elite
accessions. Including these landraces with unique alleles in cassava breeding schemes will increase the chances of
producing farmer preferred adapted elite cultivars. The study also revealed genetic differentiation among accessions
from different regions providing an opportunity for establishment of heterotic pools within a breeding programme.
La compréhension de la diversité génétique est une condition importante dans la sélection de diverses combinaisons
parentales et la formation des groupes héterotiques d’intérêt génétique pour l’amélioration des cultures. Cette
étude était conduite pour déterminer la diversité génétique parmi 51 variétés locales de manioc (Manihot esculenta)
préférées des fermiers et 15 accessions élites cultivées en Ouganda. Vingt six marqueurs simples à sequence
répétée (SSR) utilisés pour l’évaluation de la diversité génétique ont révélé un total de 154 allèles, parmi lesquelles
24% étaient des allèles uniques présentes dans les races locales seulement. La diversité génétique et l’héterozygosité
observées dans les races locales étaient légèrement supérieures que dans les accessions élites. Celles-ci s’étaient
regroupées avec quelques variétés locales indiquant donc qu’elles avaient quelques allèles en commun. Par
ailleurs, 58.8% des races locales ont formé trois différents groupes indépendamment des accessions élites. Inclure
ces races locales à allèles uniques dans les systèmes d’amélioration du manioc permettra d’augmenter les chances
de produire des cultivars élites préférés des fermiers. L’étude montre aussi que la différenciation génétique
trouvée parmi les accessions de différentes régions est une opportunité offerte pour l’établissement des groupes
héterotiques dans le programme d’amélioration.
Language:
English
Date of publication:
2012
Country:
Region Focus:
East Africa
Journal:
Volume:
20
Number:
Issue Supplement, s1
Pagination:
15-30
Collection:
RUFORUM Journal Articles
RUFORUM SCARDA and SCAIN Resources
Agris Subject Categories:
Additional keywords:
Licence conditions:
Open Access
Form:
Printed resource
Publisher:
ISSN:
1021-9730
E_ISSN:
2072-6589
Edition:
Notes:
This is a special issue of the African Crop Science Journal dedicated to research outputs arising from the efforts of SCARDA/SCAIN. A cohort of graduate students generated research findings comprising the 15 papers in this issue. The topics range from genetic analysis of important crops such as cassava and rice to factors affecting the livelihoods of pastoralists in semi-arid regions.
