Genetic Diversity among Farmer-Preferred Cassava Landraces in Uganda

Abstract: 
Understanding of genetic diversity among a breeding population is an important requirement for crop improvement as it allows for the selection of diverse parental combinations and formation of heterotic pools for genetic gain. This study was carried out to determine genetic diversity within and among 51 farmer-preferred cassava (Manihot esculenta) landraces and 15 elite accessions grown in Uganda. Twenty six simple sequence repeat (SSR) markers used for genetic diversity assessment in this study revealed a total of 154 alleles, of which 24% were unique alleles present only in landraces. The genetic diversity and observed herozygosity in landraces were slightly higher than in elite accessions. Elite accessions clustered with some of the landraces indicating that there were some alleles in common. However, 58.8% of the landraces fell into 3 different clusters independent of the elite accessions. Including these landraces with unique alleles in cassava breeding schemes will increase the chances of producing farmer preferred adapted elite cultivars. The study also revealed genetic differentiation among accessions from different regions providing an opportunity for establishment of heterotic pools within a breeding programme.
La compréhension de la diversité génétique est une condition importante dans la sélection de diverses combinaisons parentales et la formation des groupes héterotiques d’intérêt génétique pour l’amélioration des cultures. Cette étude était conduite pour déterminer la diversité génétique parmi 51 variétés locales de manioc (Manihot esculenta) préférées des fermiers et 15 accessions élites cultivées en Ouganda. Vingt six marqueurs simples à sequence répétée (SSR) utilisés pour l’évaluation de la diversité génétique ont révélé un total de 154 allèles, parmi lesquelles 24% étaient des allèles uniques présentes dans les races locales seulement. La diversité génétique et l’héterozygosité observées dans les races locales étaient légèrement supérieures que dans les accessions élites. Celles-ci s’étaient regroupées avec quelques variétés locales indiquant donc qu’elles avaient quelques allèles en commun. Par ailleurs, 58.8% des races locales ont formé trois différents groupes indépendamment des accessions élites. Inclure ces races locales à allèles uniques dans les systèmes d’amélioration du manioc permettra d’augmenter les chances de produire des cultivars élites préférés des fermiers. L’étude montre aussi que la différenciation génétique trouvée parmi les accessions de différentes régions est une opportunité offerte pour l’établissement des groupes héterotiques dans le programme d’amélioration.
Language: 
Date of publication: 
2012
Country: 
Region Focus: 
East Africa
Volume: 
20
Number: 
Issue Supplement, s1
Pagination: 
15-30
Collection: 
RUFORUM Journal Articles
RUFORUM SCARDA and SCAIN Resources
Agrovoc terms: 
Licence conditions: 
Open Access
Form: 
Printed resource
ISSN: 
1021-9730
E_ISSN: 
2072-6589
Edition: 
Notes: 

This is a special issue of the African Crop Science Journal dedicated to research outputs arising from the efforts of SCARDA/SCAIN.  A cohort of graduate students generated research findings comprising the 15 papers in this issue.  The topics range from genetic analysis of important crops such as cassava and rice to factors affecting the livelihoods of pastoralists in semi-arid regions.