Identification of QTL’s Linked for Resistance to Maize Cob Rot Caused by Fusarium graminearum in Tropical Maize

Maize cob rots caused by Fusarium graminearum cause yield losses and quality as a result of produced mycotoxins. Developing varieties resistant to cob rots is an alternative strategy that is practical and provides better insurance for the small scale farmers. The subjectivity of scoring and the varying virulence responses of these pathogens to environmental conditions make selection for resistance difficult. The objectives of this study were to i) identify quantitative trait loci (QTL’s) associated with resistance to F. graminearum and ii) evaluate the possibilities of utilising these QTL’s for marker assisted selection (MAS). A major QTL was identified on chromosome 5. The additive and dominance effects ranged from -0.11 to - 0.30 and all detected QTL’s were more than 5 cM from the nearest molecular marker utilised in the study. Therefore, there is need to utilise the maize genomic map to identify and test several markers (< 5 cM, to the detected QTL’s), in order to locate more reliable molecular markers for utilization in MAS.
La pourriture d’épi de maïs causée par Fusarium graminearum provoque la perte de rendement et de la qualité en raison de mycotoxines produites. Le developpement des variétés résistantes à la pourriture des épis est une stratégie alternative qui est pratique et offre une meilleure assurance pour les petits agriculteurs. La subjectivité de la notation et les réponses variant de virulence de ces pathogènes aux conditions environnementales rendent difficile la sélection pour la résistance. Les objectifs de cette étude étaient : i) identifier les caractères quantitatifs de locus (QTL) associées à la résistance au F. graminearum, ii) évaluer les possibilités d’utilisation de ces QTL pour la sélection assistée par marqueurs (SAM). Un QTL majeur a été identifié sur le chromosome 5. Les effets additifs et dominants variaient de -0,11 à -0,30 et tous les QTL détectés ont plus de 5 cM de plus à partir du marqueurmoléculaire le plus proches qui sont utilisés dans l’étude. Par conséquent, il y a un besoin d’utiliser la carte génomique du maïs afin d’identifier et de tester plusieurs marqueurs (<5 cM, pour les QTL détectés), afin de localiser les marqueurs moléculaires les plus fiables pour l’utilisation dans les MAS.
Extended Abstract for Crop Improvement
Date of publication: 
Region Focus: 
East Africa
RUFORUM Conferences and Workshops
Agrovoc terms: 
Licence conditions: 
Open Access
Printed resource

The 2012 RUFORUM Biennial Conference is the third in the series. The main objective of the Biennial conferences is to provide a platform for agricultural research for development stakeholders in Africa and beyond to actively exchange findings and experiences, while at the same time learning lessons towards improving performance of the agricultural sector and ultimately people’s livelihoods. The biennial conference is RUFORUM’s most comprehensive meeting for the diversity of stakeholers in agriculture. It is especially dedicated to graduate students and their supervisors, grantees in RUFORUM member universities and alumni. It is a platform for peer review, quality control, mentorship, networking and shared learning. The third Biennial Conference was attended by 657 participants.  This record contains an extended abstract accepted under the theme of Crop Improvement.