Marker Assisted Introgression of Phytophthora capsici Resistance Genes into Locally Adapted Pepper Variety cv. Scotch Bonnet

Phytophthora capsici, a soil born fungus, is one of the most important constraint to hot pepper production in Uganda, causing root rot and wilt disease. Current management approaches that are mainly cultural and chemical do not provide adequate protection against the disease. Consequently, a lot of the crop is lost. This study is broadly aiming at developing resistance against the disease. Specific objectives of the study are: (i) to test the effectiveness of molecular markers in aiding the introgression of the Phyto 5.2 QTL into susceptible varieties, and (ii) to determine the contribution of the Phyto 5.2 QTL towards resistance to P. capsici in pepper. A resistant line was crossed with a susceptible variety. F1s were screened using a SCAR and SSR markers reported to be linked to Phyto 5.2, a major QTL for resistance to the disease. A total of seven SSR markers were tested in addition to the SCAR. The SCAR marker was unfortunately not polymorphic, while only one SSR marker is promising. F2s and backcross 1 populations will be phenotypically evaluated to determine any relationship between observed resistance and presence of SSR marker.
Phytophthora capsici, un champignon né dans le sol, est l’une de plus importantes contraintes pour la production du poivre pimenté en Ouganda, provoquant la pourriture des racines et la maladie du flétrissement. Les approches de gestion actuelles qui sont essentiellement culturelles et chimiques ne fournissent pas une protection adéquate contre la maladie. Par conséquent, une grande partie de la récolte est perdue. Cette étude vise largement à développer une résistance contre la maladie. Les objectifs spécifiques de l’étude sont les suivants: (i) tester l’efficacité des marqueurs moléculaires en aidant l’incorporation des gènes de Phyto5.2 dans les variétés sensibles, et (ii) déterminer la contribution de Phyto5.2 QTL pour la résistance à P. capsici dans le poivre. Une lignée de résistance a été croisée avec une variété sensible. F1s ont été examinés à l’aide des marqueurs SCAR et SSR signalés être liés à Phyto5.2, un QTL important pour la résistance à la maladie. Un total de sept marqueurs SSR ont été testés en plus du marqueur SCAR. Ce dernier n’a malheureusement pas été polymorphe, alors que seulement un marqueur SSR est prometteur. F2s et les populations 1 croisées après seront phénotypiquement évaluées afin de déterminer une relation entre la résistance observée et la présence des marqueurs SSR.
Extended Abstract for Crop Improvement
Date of publication: 
Region Focus: 
East Africa
RUFORUM Conferences and Workshops
Agris Subject Categories: 
Licence conditions: 
Open Access
Printed resource

The 2012 RUFORUM Biennial Conference is the third in the series. The main objective of the Biennial conferences is to provide a platform for agricultural research for development stakeholders in Africa and beyond to actively exchange findings and experiences, while at the same time learning lessons towards improving performance of the agricultural sector and ultimately people’s livelihoods. The biennial conference is RUFORUM’s most comprehensive meeting for the diversity of stakeholers in agriculture. It is especially dedicated to graduate students and their supervisors, grantees in RUFORUM member universities and alumni. It is a platform for peer review, quality control, mentorship, networking and shared learning. The third Biennial Conference was attended by 657 participants.  This record contains an extended abstract accepted under the theme of Crop Improvement.