Random regression analyses using B-spline functions to model the growth of large white pigs

Abstract: 
The pigs industry in Kenya has faced many challenges, among them poor animal genetic resource base. To partly address this, genetic parameters were estimated using B-spline functions in random regression models for weight of Large White pigs measured between the 3rd and 36th week of age. The model accounted for contemporary groups, parity and sex as fixed effects while random effects modeled were; animal genetic effect, permanent environmental effect and maternal genetic effect along with heterogeneous residual variances. Heritability estimates decreased with age from 0.37 at 3 weeks to 0.27 at 36 weeks. Weight during the studied period showed initial positive genetic (0.20 – 0.91) and phenotypic correlations (0.25 – 0.91), which decreased with increase in age gap. The results from this study shows that body weight in Large White pigs is moderately heritable (0.27-0.37), especially prior to weaning, suggesting the potential for genetic gain from selection. The genetic correlations suggests that considerable genetic gain can be obtained by considering pre-weaning weight only, though the genetic correlation less than unity indicates that more genetic gain would be realized by including all the estimates of heritability throughout the growth period. In all cases, the estimates generated by this study were consistent with previous studies . This study suggests that random regression methods using B-spline are appropriate for estimating genetic parameters and genetic gain for weight in Large White pigs.
L’industrie porcine au Kenya a fait face à de nombreux défis dont une faible base des ressources génétiques animales. Pour répondre en partie cela, les paramètres génétiques ont été estimés en utilisant les fonctions B-spline dans les modèles de régression aléatoires pour le poids des porcs Large White mesurés entre la 3e et la 36e semaine d’âge. Le modèle a considéré les groupes contemporains, la parité et le sexe comme des effets fixes tandis que les effets aléatoires modélisés étaient l’effet génétique animal, effet permanent de l’environnement et l’effet génétique maternel ainsi que des variances résiduelles hétérogènes. Les estimations de l’héritabilité ont diminué avec l’âge de 0,37 (3 semaines) à 0,27 (36 semaines). Le poids au cours de la période étudiée a initialement montré des corrélations génétiques (0,20 - 0,91) et phénotypiques (0,25 - 0,91) positives qui ont ensuite diminué avec l’augmentation de l’écart d’âge. Les résultats de cette étude montrent que le poids corporel chez les porcs Large White est modérément héritable (0,27 - 0,37), en particulier avant le sevrage, suggérant le potentiel de gain génétique de la sélection. Les corrélations génétiques suggèrent que le gain génétique considérable peut être obtenu en considérant le poids avant sevrage seulement, bien que la corrélation génétique inférieure à l’unité indique que le gain plus génétique serait réalisé en incluant toutes les estimations de l’héritabilité pendant toute la période de croissance. Dans tous les cas, les estimations générées par cette étude sont cohérentes avec les études disponibles existantes dans la littérature. Cette étude suggère que les méthodes de régression aléatoire en utilisant B-spline sont appropriées pour l’estimation des paramètres génétiques dans les porcs Large White et le gain pondéral génétique.
Language: 
Date of publication: 
2016
Country: 
Region Focus: 
East Africa
Volume: 
14
Number: 
Part 2
Pagination: 
799 - 805.
Collection: 
RUFORUM Working document series
RUFORUM Conferences and Workshops
Licence conditions: 
Open Access
Access restriction: 
Form: 
Web resource
Publisher: 
ISSN: 
1607-9345
E_ISSN: 
Edition: